Zein da PCR eta antigeno COVID-19 probaren arteko aldea? Biologo molekular batek azaltzen du
Zein da PCR eta antigeno COVID-19 probaren arteko aldea? Biologo molekular batek azaltzen du
Anonim

Pandemiaren une honetan, zuk edo ezagutzen duzun norbaitek gutxienez COVID-19 proba bat jaso duzu. Baina ba al dakizu zein proba mota egin duzun eta proba ezberdin horien indarguneak eta ahuleziak?

Biologo molekularra naiz, eta 2020ko apiriletik RADx izeneko Osasun Institutu Nazionalak finantzatutako programa batean lan egiten ari naiz, pertsona bat SARS-CoV-rekin kutsatuta dagoen detektatzeko proba azkarrak garatzen laguntzen ari dena. 2, COVID-19 eragiten duen birusa.

Bi proba mota nagusi erabiltzen dira SARS-CoV-2-ren infekzioa diagnostikatzeko: proba molekularrak - PCR proba gisa ezagutzen direnak - eta antigeno-probak. Bakoitzak birusaren zati ezberdin bat detektatzen du, eta funtzionatzen duen moduak eragina du probaren abiaduran eta zehaztasun erlatiboan. Beraz, zein dira proba mota horien arteko desberdintasunak?

Ebidentzia genetikoen bila

Proba mota bateko zein besteko lehen urratsa pazientearen lagin bat lortzea da. Hau sudur-zulo bat edo listu pixka bat izan daiteke.

PCR probetarako, hurrengo urratsa material genetikoa handitzea da, pazientearen laginean koronavirusaren gene kopuru txiki bat ere detektatu ahal izateko. Polimerasaren kate-erreakzioa deritzon teknika erabiliz egiten da. Osasun-langile batek lagina hartu eta RNA bikoitzeko DNA bihurtzen duen entzima batekin tratatzen du. Ondoren, DNA polimerasa izeneko entzima bat duen disoluzio batekin nahasten da eta berotzen da, DNA kate bakarreko bi DNA zatitan banatzea eraginez. Tenperatura jaisten da, eta polimerasa, primer izeneko DNA gidari zati txiki baten laguntzaz, kate bakarreko DNAri lotu eta kopiatzen du. Primerek koronavirusaren DNA bakarrik anplifikatzen dela ziurtatzen dute. Orain koronavirusaren DNAren bi kopia sortu dituzu jatorrizko RNA zati batetik.

Laborategiko makinek berotze- eta hozte-ziklo hauek 30 eta 40 aldiz errepikatzen dituzte, DNA bikoiztuz jatorrizko piezaren mila milioi kopia izan arte. Sekuentzia anplifikatuak makina batek irakurtzen duen koloratzaile fluoreszentea dauka.

PCRren anplifikazio propietateari esker, probak lagin bateko koronavirusaren material genetiko kopuru txikiena ere arrakastaz detektatzeko aukera ematen du. Horrek proba oso sentikorra eta zehatza bihurtzen du. %100era hurbiltzen den zehaztasunarekin, SARS-CoV-2 diagnostikatzeko urrezko estandarra da.

Hala ere, PCR probek ahultasun batzuk ere badituzte. Laborategiko teknikari trebea eta ekipamendu berezia behar dituzte martxan jartzeko, eta anplifikazio prozesuak ordubete edo gehiago iraun dezake hasieratik amaierara. Normalean, proba-instalazio zentralizatu handiek bakarrik (ospitaleetako laborategiek adibidez) PCR proba asko egin ditzakete aldi berean. Laginak jaso, garraiatu, anplifikatu, detektatu eta jakinarazi bitartean, 12 ordutik bost egun arte igaro daitezke pertsona batek emaitzak itzultzeko. Eta, azkenik, ez dira merkeak 100 $ edo gehiago proba bakoitzeko.

Antigeno-probak

Proba azkar eta zehatzak ezinbestekoak dira SARS-CoV-2 bezalako birus oso kutsakorra edukitzeko. PCR probak zehatzak dira, baina denbora luzea izan dezakete emaitzak lortzeko. Antigenoaren probak, koronavirusaren beste proba mota nagusia, askoz azkarragoak badira ere, ez dira hain zehatzak.

Antigenoak gorputzari erantzun immunologikoa sortzen duten substantziak dira; antigorputzak sortzea eragiten dute. Proba hauek laborategietan egindako antigorputzak erabiltzen dituzte SARS-CoV-2 birusaren antigenoak bilatzeko.

Antigenoaren proba egiteko, lehenik eta behin lagin bat zelulak eta beste partikula batzuk hausten dituen gatza eta xaboia dituen likido batekin tratatzen duzu. Ondoren, likido hori SARS-CoV-2-ren aurkako antigorputz espezifikoak margo mehe batean margotuta dituen proba-banda batean aplikatzen duzu.

Zure gorputzeko antigorputzak bezala, proba-bandan daudenak laginaren edozein antigenorekin lotuko dira. Antigorputzak koronavirusaren antigenoekin lotzen badira, proba-zerrendan koloretako marra bat agertzen da SARS-CoV-2 presentzia adierazten duena.

Antigeno probek indargune ugari dituzte. Lehenik eta behin, erabiltzeko hain errazak dira, prestakuntza berezirik ez duten pertsonek egin ditzakete eta emaitzak interpreta ditzakete, baita etxean ere. Emaitzak ere azkar sortzen dituzte, normalean 15 minutu baino gutxiagotan. Beste abantaila bat da proba hauek nahiko merkeak izan daitezkeela $ 10- $ 15 proba bakoitzeko.

Antigenoen probek desabantaila batzuk dituzte. Egoeraren arabera, PCR probak baino zehatzagoak izan daitezke. Pertsona bat sintomatikoa denean edo sisteman birus asko daukanean, antigeno-probak oso zehatzak dira. Hala ere, PCR molekularreko probek ez bezala, antigenoen probek ez dute bilatzen ari diren gauza handitzen. Horrek esan nahi du laginean antigeno biral nahikoa egon behar dela proba-bandan dauden antigorputzak seinale bat sortzeko. Pertsona bat infekzioaren hasierako fasean dagoenean, ez dago birus asko sudurrean eta eztarrian, eta bertatik hartzen dira laginak. Beraz, antigenoen probek COVID-19aren hasierako kasuak galdu ditzakete. Etapa horretan ere pertsona batek ez du sintomarik izaten, eta, beraz, litekeena da kutsatuta dagoela ez jakitea.

Proba gehiago, ezagutza hobea

Antigeno-proba batzuk dagoeneko eskuragarri daude mostradorean, eta 2021eko urriaren 4an, Elikagaien eta Droga Administrazioak larrialdietarako baimena eman zion etxeko beste antigeno-proba bati. AEBetako gobernuak proba hauek publikoarentzat eskuragarriago jartzeko ere bultzatzen ari da.

RADx-en, parte naizen proiektuan, azterketa klinikoak egiten ari gara, antigeno-testek infekzio-fase ezberdinetan nola funtzionatzen duten hobeto ezagutzeko. Zenbat eta datu gehiago izan zehaztasuna denboran zehar nola aldatzen den jakiteko, orduan eta eraginkorrago erabili ahal izango dira proba hauek.

PCR eta antigeno proben indarguneak eta mugak ulertzeak, eta horiek noiz erabili, COVID-19 pandemia kontrolatzen lagun dezake. Beraz, COVID-19ko proba egiten duzun hurrengoan, aukeratu zuretzako egokia dena.

Nathaniel Hafer, Irakasle laguntzailea, Medikuntza Molekularreko Programa, UMass Chan Medical School

Gaiaren arabera ezaguna